虽然目标管理是现在使用最广泛的管理方法之一，但一些人对其效果还持怀疑态度。人们常常批评目标管理实施上的错误，但是另一种批评的理由是目标管理作为一种机械的方法，注重的是管理过程中的某几个方面，而并没有将其综合到一个系统之中。
目标管理的优势
有大量的研究(其中许多来自实证研究)证明明确的目标具有激励作用。下面列出的是它的其他一些优势。
- 通过结果导向的计划促进管理工作的改善。
- 界定组织的任务和结构，根据对执行任务人员的期望结果进行授权。
- 鼓励个人对自己和组织的目标全心投入。
- 有利于开展有效的控制与结果的度量，并采取纠正措施。
目标管理的不足及改进建议
尽管目标管理系统有很多优势，但它也存在一些不足。这些不足大多是在实施过程中产生的。
(1)没有充分说明目标管理的宗旨是一些计划存在缺陷的原因之一。管理者必须向下属解释目标管理是什么、如何产生作用、为什么要实行目标管理以及在绩效评估时它起什么作用等问题，其中最重要的是要说明它对参与者有什么好处。这个宗旨是建立在自我控制和自我监督的概念基础上的。
(2)没有给目标制定者提供指导通常是目标管理的另一个问题。管理者必须明确企业的目标是什么以及他们的活动怎样适应这种目标，同时需要了解计划的前提条件和公司的主要政策。
(3)在制定可考核目标时，掌握合理的弹性也是有困难的。参与目标管理计划的人有时说，过于强调经济效果会对个人产生压力，也可能导致违背伦理行为的发生。为了减少选择不道德手段实现目标的可能性，高层管理者必须承认合理的目标，明确表示出对道德行为的期望，并给道德行为以高度优先地位，不吝惜奖励。同时，对不道德的行为，要坚决予以惩罚。
(4)强调短期目标会以组织的长远健康发展为代价。
(5)目标如果缺乏灵活性，就会使管理者在改变目标时犹豫不决一一即使在环境发生变化，亟需调整目标的时候。
(6)目标管理的其他潜在危险包括：为了使目标便于考核，人们可能会过多地使用定量目标，甚至对不宜用数字来表示的一些目标也试图利用数字量化表达，抑或是用数字表示一些项目的最终成果进而致使重要目标被忽视。例如，良好的公司形象的确可以成为一个企业的重要优势，然而究竟怎样才算良好却是难以量化界定的。另外，人们还可能会因为推行目标管理而遗漏除了目标制定之外的其他管理工作。
然而，尽管目标管理在某些情况下存在着困难与危害，但这种系统所注重的目标制定工作长期以来确实是人们公认的计划与管理工作的核心。
案例：制定切实可行的目标
一位分公司经理最近听了一个目标管理讲座，他的热情当场就被激发出来，讲座加深了他对于目标管理的认识。最后他决定，在下一次员工会议上介绍这个概念并观察能有什么进展。他细述了这种方法的理论发展情况，列举了在公司使用它的好处，并且要求他的下属考虑采纳引入它的建议。
事实并不像人们想像的那样简单。在员工会议上，与会者提出了很多问题。财务主任问道：
“你是否有总裁分派给你的明年分公司的目标？”
“不，我没有，”分公司经理答道，“但我一直在等总裁办公室告诉我他们期望我做什么。不过他们显得若无其事。”
“那分公司要做什么呢？”生产主任问道，他不希望限制下属的活动。
“我打算列出我对分公司的期望，”这位分公司经理说，“这没有什么可保密的，我希望销售额达到3 000万美元，税前利润率达到8％，投资收益率为15％，那个正在进行的项目在6月30号之前投产。我以后还会列出一些明确的指标来选拔我们未来的管理人员；我们要在今年年底前完成XZ型的开发；雇员的流动率要保持在5％。”
与会人员面对他们上级考虑之后提出的这些可考核目标，对他如此明确和自信的陈述有点目瞪口呆。他们也对他要求实现这些目标的开诚布公感到惊奇。
“下个月，我要求你们每个人把这些目标转换成各自的可考核目标。显然，这些目标对财务、营销、生产、工程和行政工作来说是不同的。不管你们如何表述这些目标，我希望它们合在一起就能实现分公司的目标。”